Ncbi sprādziens

1. Kāpēc lieto NCBI BLAST??
2. Vai NCBI BLAST ir programmatūra?
3. Kā atrast BLAST?
4. Kas ir NCBI GenBank?

Kāpēc lieto NCBI BLAST??

Pamata vietējās izlīdzināšanas meklēšanas rīks (BLAST) atrod reģionus ar vietējo līdzību starp olbaltumvielu vai nukleotīdu sekvencēm. Programma salīdzina nukleotīdu vai proteīnu sekvences ar secību datu bāzē un aprēķina atbilstību statistisko nozīmīgumu.

Vai NCBI BLAST ir programmatūra?

1990. gadā Nacionālā biotehnoloģijas informācijas centra (NCBI) pētnieki izlaida jaunu programmatūras pakotni ātrai DNS un olbaltumvielu secības salīdzināšanai [15].

Kā atrast BLAST?

BLAST secības līdzības meklēšana

1. Lapas augšdaļā esošās rīkjoslas cilnē “Blast” atlasiet secības līdzības meklēšanu ar programmu Blast.
2. Formas laukā ievadiet olbaltumvielu vai nukleotīdu secību vai UniProt identifikatoru (37. attēls).
3. Noklikšķiniet uz pogas “Run Blast”.

Kas ir NCBI GenBank?

GenBank® ir visaptveroša datubāze, kas satur publiski pieejamas nukleotīdu sekvences vairāk nekā 300 000 organismiem, kas nosaukti ģints līmenī vai zemāk, un kas iegūta galvenokārt, iesniedzot atsevišķu laboratoriju iesniegumus un partijas iesniegumus no liela mēroga sekvencēšanas projektiem, ieskaitot visa genoma bisi ( ...