Secību datu bāze

Bioinformātikas jomā secību datubāze ir bioloģiskās datubāzes veids, kas sastāv no lielas datorizētu ("digitālu") nukleīnskābju sekvenču, proteīnu sekvenču vai citu datorā saglabātu polimēru secību kolekcijas. UniProt datu bāze ir proteīnu secības datu bāzes piemērs.

1. Kādas ir trīs galvenās primārās secības datu bāzes?
2. Kas ir bioloģisko secību datu bāze?
3. Kas ir secība bioinformātikā?
4. Kas ir nukleotīdu secību datu bāze?

Kādas ir trīs galvenās primārās secības datu bāzes?

Ir trīs galvenās secību datu bāzes: Japānas DNS datu banka (DDBJ) (http: // www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html), EMBL nukleotīdu secības datu bāze (EMBL-Bank) (http: // www.ebi.ac.uk/embl/) un GenBank (http: // www.ncbi.nlm.NIH.gov/genbank/).

Kas ir bioloģisko secību datu bāze?

To var uzskatīt par vairāku mantojuma klases hierarhiju. Viena hierarhija ir pamatā esošo molekulu tipa hierarhija: DNS, RNS vai proteīns. Otra hierarhija ir veids, kā pamatā esošo bioloģisko secību attēlo datu struktūra.

Kas ir secība bioinformātikā?

Bioinformātikā secību analīze ir process, kurā DNS, RNS vai peptīdu secību pakļauj jebkurai no plaša spektra analītiskajām metodēm, lai izprastu tās pazīmes, funkciju, struktūru vai evolūciju. Izmantotās metodes ietver secību izlīdzināšanu, meklēšanu pēc bioloģiskajām datu bāzēm un citas.

Kas ir nukleotīdu secību datu bāze?

Nukleotīdu datu bāze ir secību kolekcija no vairākiem avotiem, tostarp GenBank, RefSeq, TPA un PBP. Genoma, gēnu un transkripta secības dati nodrošina pamatu biomedicīnas pētījumiem un atklājumiem.